复杂的申请材料：申请增值电信业务经营许可证需要准备一系列详尽的材料，包括但不限于公司营业执照副本、公司章程、股东结构、业务发展计划、技术方案、网络与信息安全保障措施等。这些材料需要详细、准确，且符合特定的格式和要求，对于不熟悉流程的申请者来说，准备这些材料可能会感到困难和繁琐。

严格的审核标准：审批机构对申请材料的审核非常严格，任何小的错误或遗漏都可能导致申请被驳回，需要重新提交。此外，审批机构可能会对申请者的公司背景、财务状况、技术能力等进行综合评估，确保申请者具备长期稳定提供服务的能力和信誉。

前置审批项目：对于某些特定类型的增值电信业务，还需要获得相关主管部门的事先审核同意，这增加了申请的复杂性和难度。

法律法规遵循：申请者需要严格遵守《中华人民共和国电信条例》、《电信业务经营许可管理办法》等相关法律法规，这些法规对电信业务经营者的权利和义务、经营行为的规范等都有明确的规定，申请者必须确保其业务模式和运营计划符合所有相关法律法规的要求。

专业知识要求：办理增值电信业务经营许可证需要一定的专业知识，包括对电信行业的理解、对相关法律法规的熟悉以及对申请流程的掌握。对于初次接触这一流程的申请者来说，可能需要花费大量时间和精力来学习和适应。

时间成本：从提交申请到最终获得许可证，整个过程可能需要较长的时间，尤其是在材料审核、补充和修改过程中。这个时间成本对于一些急于开展业务的企业来说可能是一个挑战。

监管环境的变化：随着互联网技术的发展和监管政策的更新，申请增值电信业务经营许可证的要求和流程可能会发生变化，申请者需要及时关注和适应这些变化。